该成果是利用全基因组范围内的标记信息估计基因组育种值(genomic estimate breeding value, GEBV)的方法,涉及育种芯片、大数据、高性能计算等,是育种技术中的新一代“高、精、尖”技术。全基因组选择作为最新的高精尖育种技术,能够从基因本质上区分优秀个体。
在硒都黑猪新品种培育过程中,采用“中芯一号”芯片对参考群体进行基因组信息检测,应用ssGBLUP算法构建育种值估计动物模型,分别对生长和育肥性状的GEBV进行计算,结果表明达90公斤体重日龄的GEBV与表型秩相关r2为0.65,达90公斤体重背膘厚的GEBV与表型的秩相关r2为0.64。可用此方法进行后续群体的GEBV计算。
在大白猪群中,通过50K基因芯片进行基因组信息检测,对产仔数性状进行分析,通过5倍交叉验证的方式计算ssGBLUP和BLUP计算育种值的准确性,结果表明,对于总产仔数性状ssGBLUP的准确性达到55.37%,产活仔数的准确性达到57%,相比于BLUP方法分别提升30.7%和34.6%。
该成果可用于硒都黑猪和大白猪等猪群的重要经济性状的基因组选育工作中。
2022年该成果在贵州沿生态牧业有限责任公司进行了示范,对5000头大白猪群体中进行了应用,共检测芯片样本2200头,使用后生产性能提高明显,窝均总产仔数由14.3头提高到14.8头,百公斤体重日龄由158.4天提高到154.6天,2022年增收1000万元。
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